Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms