Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms