Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prima1Q810F0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms