Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Negr1Q80Z24 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms