Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrfn4Q80XU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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