Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2bQ80XK6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2bQ80XK6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms