Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AknaQ80VW7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AknaQ80VW7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms