Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep170bQ80U49 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms