Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf8Q80TJ7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf8Q80TJ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms