Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms