Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg2Q7TMS5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcg2Q7TMS5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcg2Q7TMS5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcg2Q7TMS5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcg2Q7TMS5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcg2Q7TMS5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcg2Q7TMS5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms