Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sys1Q78S06 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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