Protein–RNA interactions for Protein: Q78EE2

Gm21292, Predicted gene, 21292, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21292Q78EE2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21292Q78EE2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21292Q78EE2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21292Q78EE2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms