Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd3eapQ76KJ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd3eapQ76KJ5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms