Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfflQ6ZQM0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms