Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms