Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nemp1Q6ZQE4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms