Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp34Q6ZQ93 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp34Q6ZQ93 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms