Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Efr3bQ6ZQ18 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efr3bQ6ZQ18 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efr3bQ6ZQ18 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efr3bQ6ZQ18 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efr3bQ6ZQ18 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efr3bQ6ZQ18 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Efr3bQ6ZQ18 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Efr3bQ6ZQ18 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Efr3bQ6ZQ18 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Efr3bQ6ZQ18 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Efr3bQ6ZQ18 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Efr3bQ6ZQ18 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Efr3bQ6ZQ18 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3bQ6ZQ18 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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