Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy1Q6ZQ11 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms