Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc44a1Q6X893 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms