Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asic3Q6X1Y6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Asic3Q6X1Y6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Asic3Q6X1Y6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Asic3Q6X1Y6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Asic3Q6X1Y6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asic3Q6X1Y6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asic3Q6X1Y6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms