Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cxcl3Q6W5C0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms