Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms