Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms