Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gja6Q6S5G4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gja6Q6S5G4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms