Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr12Q6QNU9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr12Q6QNU9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms