Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b4Q6Q477 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b4Q6Q477 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms