Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc57Q6PHN1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms