Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad54bQ6PFE3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms