Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gramd2bQ6PEM6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gramd2bQ6PEM6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms