Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrm2bQ6PEE3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms