Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms