Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf1Q6PDM2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms