Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx4Q6PDK8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx4Q6PDK8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms