Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms