Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc3bQ6PDC0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms