Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slf2Q6P9P0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf2Q6P9P0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms