Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp49Q6P9L4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms