Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms