Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp12Q6P5B0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms