Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Podnl1Q6P3Y9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms