Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms