Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrimpolQ6P1E7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms