Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxip1Q6NZQ4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxip1Q6NZQ4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms