Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SphkapQ6NSW3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms