Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Amer3Q6NS69 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms