Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms