Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw2Q6I6G8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms