Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms